БакСкрин и БакРезиста - новый способ быстрого и достоверного выявления возбудителей инфекционно-воспалительной патологии
В медицинском центре «Гармония» доступны два новых ПЦР-теста для выявления условно-патогенных бактерий и определения генов резистентности бактерий к антибиотикам.
БакСкрин – тест для выявления 25 условно-патогенных бактерий (количественно).
БакРезиста – тест для выявления 14 генов резистентности к бета-лактамных и гликопептидным антибиотикам у грамположительных и грамотрицательных бактерий (количественно).
Показания для исследования: инфекционно-воспалительные заболевания любой локализации.
Материал для исследования:
- Моча
- Эякулят
- Секрет простаты
- Отделяемое урогенитального тракта (уретра, цервикальный канал, влагалище)
- Отделяемое ЛОР-органов и дыхательных путей
- Раневое отделяемое
- Аспираты, транссудаты
- Соскобы с кожи
- Фекалии
Особенности хранения и транспортировки биоматериала до доставки в лабораторию:
биоматериал может храниться до 24 часов в холодильнике при 2-8 С.
Готовность:до 1-2 рабочих дня.
Стоимость исследования:
БакСкрин – 3200 рублей *
БакРезиста – 1500 рублей*
Комплекс БакСкрин+БакРезиста – 3900 рублей*
Стоимость взятия биоматериала оплачивается отдельно.
Важно! Тесты БакСкрин и БакРезиста могут быть выполнены пациентам по направлению врача из другой клиники. Прием врача в Медицинском центре «Гармония» в этом случае не нужен, достаточно направления в произвольной форме.
Важно! Пробы выделенной ДНК хранятся в лаборатории в течение 3 недель. Возможен заказ дополнительных тестов из материала на хранении.
* Цена актуальна на момент написания статьиПример бланка результатов теста БакСкрин
Формат выдачи результата – количественный в Lg ГЭ/образец
Тест БакСкрин
Актуальность исследования
Проблема 21-го века – инфекционно-воспалительные заболевания, вызванные оппортунистическими (условно-патогенными) микроорганизмами (УПМ), которые в отличие от возбудителей инфекционных болезней, входят в состав нормальной микробиоты организма человека. Многие из них сложно культивировать in vitro, а просто факт обнаружения не является подтверждением этиологической значимости.
УПМ могут вызывать инфекционный процесс при ослаблении иммунной защиты и воздействии определенных факторов. К ним относятся хронические заболевания, травматические состояния, прием некоторых медикаментов, пребывание в стационаре, беременность и роды, преклонный и детский возраст.
УПМ могут вызывать инфекции различной локализации и степени тяжести: от гнойно-воспалительных заболеваний кожи до инфекций мочевыводящих путей, пневмонии, некротического фасциита и менингита. Они также могут быть причиной внебольничных инфекций, например, поражений верхних и нижних дыхательных и мочевыводящих путей, кожи и мягких тканей и т.д. Особенно тяжело такие инфекции могут протекать у пациентов, имеющих различные хронические заболевания (сахарный диабет, муковисцидоз, и другие).
Заболевания, вызванные разными УПМ,схожи по клинике, поэтому точно установить возбудителя без лабораторных исследований невозможно. Дифференциальная диагностика необходима для подбора терапии, в том числе в связи с приобретением УПМ новых свойств, таких так антибиотикорезистентность и способность к адгезии и пленкообразованию.
По предложению Американского общества инфекционных болезней (Infectious Diseases Society of America, IDSA), несколько представителей УПМ выделены в отдельную группу ESKAPE-патогенов — значимых возбудителей нозокомиальных инфекций, способных «избегать» бактерицидного воздействия антибиотиков (Enterococcus faecium, Staphylococcus aureus, Klebsiella pneumoniaе, Acinetobacter baumannii, Pseudomonas aeruginosa, Enterobacter spp.)
Наиболее значимые условно-патогенные микроорганизмы и их роль в патологии
Грамположительные бактерии | ||
Staphylococcus spp. | Особенно опасны для пациентов с ослабленным иммунитетом, хроническими заболеваниями и при длительном пребывании в стационаре. Часто обладают резистентностью к антибиотикам | |
Staphylococcus aureus | Может приводить к развитию бактериемии, эндокардита, костно-суставных и плевропульмональных инфекций, а также инфекций кожи и мягких тканей. Особо клинически значим для больных с муковисцидозом. ESKAPE патоген | |
Streptococcus spp. | Могут вызывать различные по локализации и степени тяжести инфекции, включая инвазивные | |
Streptococcus agalactiae | Может вызывать менингиты, бактериемии у новорожденных; послеродовые инфекции у рожениц | |
Streptococcus pneumoniae | Один из основных возбудителей пневмоний в мире, поражает пациентов с ослабленным иммунитетом | |
Streptococcus pyogenes | Вызывает как легкие, так и тяжелые инфекции, включая некротический фасциит, синдром стрептококкового токсического шока и бактериемию | |
Enterococcus spp. | E. faecium (80–90% от всех выделенных у человека энтерококков) вызывает нозокомиальную инфекцию, часто обладает резистентностью к антибиотикам, ESKAPE патоген. E. faecalis (5–10%) — возбудитель внебольничных инфекций | |
Грамотрицательные бактерии | ||
Enterobacterales | Включает в себя множество клинически значимых представителей УПМ (Citrobacter spp, E. coli, Klebsiella spp. и др.) | |
Escherichia coli | Доминирующий возбудитель нозокомиальных инфекций, встречается с множественной резистентностью к антибиотикам | |
Klebsiella pneumoniae | Часто приводит к инфекционным патологиям и фатальным последствиям у пациентов с иммуносупрессией. ESKAPE-патоген | |
Klebsiella pneumoniae / Klebsiella oxytoca | Встречаются мультирезистентные к антибиотикам штаммы К. oxytoca | |
Morganella morganii | Вызывает инфекции послеоперационных ран и мочевыводящих путей. Некоторые штаммы обладают устойчивостью к нескольким антибиотикам. Может вызывать различные инфекционные заболевания с высокой смертностью | |
Serratia marcescens | Вызывает вспышки нозокомиальных инфекций различной степени тяжести. Некоторые изоляты резистентны к β-лактамазам расширенного спектра или к имипенему | |
Citrobacter freundii | Часто приобретает множественную лекарственную устойчивость к антибактериальным препаратам | |
Citrobacter koseri | Часто вызывает инфекционные процессы у новорожденных и у пациентов с ослабленным иммунитетом [ | |
Enterobacter cloacae | Обладает резистентностью к антибиотикам. ESKAPE-патоген | |
Proteus spp. | P. mirabilis, P. vulgaris вызывают инфекции мочеполового тракта, раневые инфекции и менингит. P. mirabilis обладает множественной лекарственной устойчивостью | |
Haemophilus spp. | Ряд клинически значимых видов (H. influenzaе, H. parainfluenzae, H. haemolyticus и тд.). H. parainfluenzae может вызывать до 4% внебольничных пневмоний | |
Haemophilus infl uenzae | Более 90% инвазивных форм инфекции H. influenzae приходится на детей в возрасте до 5 лет, большинство которых составляют дети грудного возраста. Один из основных возбудителей инфекции легких у больных с муковисцидозом | |
Acinetobacter spp. | Бактерии рода Acinetobacter — частые возбудители тяжелых нозокомиальных инфекций. A. baumannii относится к опасным патогенам с множественной лекарственной устойчивостью, входит в группу особо значимых ESKAPE-патогенов | |
Achromobacter ruhlandii | Наиболее клинически значимы для больных с муковисцидозом, доминируют в российской популяции | |
Achromobacter xylosoxidans | ||
Burkholderia spp. | Клинически значимы для больных с муковисцидозом | |
Pseudomonas aeruginosa | Клинически значим для больных с муковисцидозом. ESKAPE-патоген | |
Stenotrophomonas maltophilia | Часто обладает множественной лекарственной устойчивостью. Клинически значим для больных с муковисцидозом | |
Диагностика оппортунистических бактериальных инфекций
Для диагностики бактериальных инфекций используются микроскопические, культуральные, серологические и молекулярно-генетические методы.
- Световая микроскопия мазков, окрашенных по Граму, позволяет сделать вывод о характере микрофлоры и о соотношениях ее компонентов.
- Бактериологический посев используют для выделения чистых культур микроорганизмов и определения их видовой принадлежности. В сочетании с этим методом возможно определение чувствительности бактерий к антибиотикам.
- Серологические методы позволяют обнаружить антитела или антигены в крови пациента. Однако у этого метода есть ряд ограничений: он проводится через несколько дней после начала болезни, а также не отличается высокой специфичностью (могут наблюдаться перекрестные реакции с антителами против других возбудителей).
- Молекулярно-биологические методы предназначены для обнаружения специфических фрагментов микроорганизма и идентификации возбудителя. Полимеразная цепная реакция (ПЦР) в режиме реального времени — это высокочувствительный метод, который позволяет быстро получить результат.
Тест БакСкрин – 25 условно-патогенных бактерий количественно методом ПЦР в реальном времени
Спектр выявляемых показателей:
- Общая бактериальная масса (ОБМ)
- Грамположительные
- Streptococcus spp.,
- Streptococcus pyogenes,
- Streptococcus pneumoniae,
- Streptococcus agalactiae,
- Staphylococcus spp.,
- Staphylococcus aureus,
- Enterococcus spp.
- Грамотрицательные
- Enterobacterales,
- Escherichia coli,
- Citrobacter freundii,
- Citrobacter koseri,
- Klebsiella pneumoniae/Klebsiella oxytoca,
- Klebsiella pneumoniae,
- Enterobacter cloaca,
- Serratia marcescens,
- Proteus spp.,
- Morganella morganii,
- Pseudomonas aeruginosa,
- Haemophilus spp.,
- Haemophilus influenzaе,
- Burkholderia spp.,
- Acinetobacter spp.,
- Stenotrophomonas maltophilia,
- Achromobacter ruhlandii,
- Achromobacter xylosoxidans
Преимущества ПЦР-диагностики по сравнению с другими методами исследования
- Быстро – получение результатов в течение 1-2 рабочих дней
- Надежно - высокая чувствительность и специфичность
- Комплексно - выявление всех, в том числе трудно культивируемых микроорганизмов
- Точно - идентификация микроорганизмов до заданного таксономического порядка
- Универсально - Исследование широкого спектра биоматериала
- Быстро – получение результатов в течение 1-2 рабочих дней
- Надежно - высокая чувствительность и специфичность
- Комплексно - выявление резистентности у всех, в том числе трудно культивируемых микроорганизмов
- Точно – выявляет все устойчивые бактерии, в том числе с «молчащими генами», которые не определяются фенотипически
- Универсально - Исследование широкого спектра биоматериала
Правила подготовки пациента к исследованию, условия отбора и хранения исследуемого биоматериала
Вид биоматериала | Подготовка | Хранение |
Моча |
| При 2-8 С (холодильник) до 24 часов |
Секрет простаты | Отбирает врач уролог на приеме | При 2-8 С (холодильник) до 24 часов |
Эякулят | Воздержание от половых контактов 3-4 дней, сбор в стерильный одноразовый контейнер путем мастербации (после туалета наружных половых органов и мочеиспускания) | При 2-8 С (холодильник) до 24 часов |
Фекалии | Для анализа собирают пробумассой (объёмом) примерно 1–3 г (1–3 мл в специальный стерильный сухой флакон | При 2-8 С (холодильник) до 48 часов |
Мазки\соскобы из дыхательных путей | Отбирает медицинская сестра или врач. | При 2-8 С (холодильник) до 24 часов |
Мазки\соскобы из урогенитального тракта у женщин (цервикальный канал, влагалище) |
| При 2-8 С (холодильник) до 24 часов |
Мазки\соскобы из урогенитального тракта у мужчин(уретра) | При 2-8 С (холодильник) до 24 часов | |
Раневое отделяемое | Отбирает медицинская сестра или врач | При 2-8 С (холодильник) до 24 часов |
Экссудаты, транссудаты | Отбирает медицинская сестра или врач | При 2-8 С (холодильник) до 24 часов |
Тест БакРезиста
Актуальность исследования
Серьезная проблема, с которой столкнулось человечество в борьбе с инфекционными агентами – это устойчивость к антибактериальным препаратам. Мы все понимаем, что антибиотики спасают жизни и необходимы для борьбы с инфекционными заболеваниями. Именно по этой причине середина 20-го века, когда были созданы первые антибиотики, стала поистине золотой эрой антибиотикотерапии.Благодаря антибиотикам и вакцинам кардинально изменилась структура смертности и существенно выросла продолжительность жизни.
Однако на появление каждого нового антибиотика микробный мир отвечает появлением резистентных штаммов, а гены резистентности сохраняются в геноме бактерий. Так метициллин резистентный штамм стафилококка (MRSA) был впервые зарегистрирован всего через 2 года после создания метициллина.
В последние десятилетия распространенность штаммов микроорганизмов, устойчивых к антибактериальным препаратам (АБП), значительно затрудняет лечение пациентов с бактериальными инфекциями. Устойчивость к АБП препятствует эффективной терапии и способствует появлению хронических и рецидивирующих инфекций. Заболевания, вызванные антибиотикорезистентными штаммами, отличаются длительным течением, часто продолжительным пребыванием в стационаре и неблагоприятным прогнозом для пациентов.
Резистентность микроорганизмов может быть природной и приобретенной, но ее формирование во всех случаях обусловлено генетически. При этом гены устойчивостизачастую локализованы на мобильных генетических элементах и способны к быстрому распространению как внутри одного вида, так и между разными видами бактерий. Интенсификации этого процесса способствуют избыточное и необоснованное назначение антибактериальных препаратов; самолечение, сопровождающееся недостаточностью знаний об этиологии инфекционного процесса, спектре действия антибиотиков; использование АБП для лечения и стимуляции роста животных и птиц в сельском хозяйстве.
Наиболее значимые гены резистентности к бета-лактамным и гликопептидным антибиотикам у грамположительных и грамотрицательных бактерий
Ген резистентности | Бактерии, у которых данный ген может присутствовать | Антибиотики |
van A/B | грамположительные | ванкомицин, тейкоплакин |
mec A | грамположительные | метициллин, оксациллин |
tem | грамотрицательные | пенициллины и цефалоспорины |
ctx-M-1 | грамотрицательные | |
shv | грамотрицательные | |
oxa-40-like | грамотрицательные | карбапенемы |
oxa-48-like | грамотрицательные | |
oxa-23-like | грамотрицательные | |
oxa-51-like | грамотрицательные | |
imp | грамотрицательные | |
kpc | грамотрицательные | |
ges | грамотрицательные | |
ndm | грамотрицательные | |
vim | грамотрицательные |
Методы определения антибиотикорезистентности у бактерий
Для выявления резистентности к АБП применяют фенотипические (микробиологические) и молекулярно-генетические методы, в том числе полимеразную цепную реакцию (ПЦР).
Результаты, полученные с применением ПЦР, коррелируют с диско-диффузионным методом и методом серийных разведений. При этом ПЦР-исследование не требует манипуляции с живыми бактериальными культурами, что предотвращает распространение и циркуляцию микроорганизмов внутри лечебно-диагностических и лабораторных учреждений. ПЦР-диагностика позволяет значительно ускорить получение результатов — это особенно важно для лечения тяжелых инфекций, поскольку эффект этиотропной терапии во многом зависит от времени назначения подходящих антибиотиков
Определение генов резистентности к антибиотикам — важная дополнительная клиническая информация для врача при подборе эффективной терапии, она не может быть получена микробиологическим методом определения чувствительности.
ПЦР-диагностика — прямой метод, который позволяет проводить определение генов антибиотикорезистентности у труднокультивируемых микроорганизмов. На результат ПЦР-исследования не влияют режимы хранения антибактериальных препаратов и питательных сред.
Преимущества ПЦР-диагностики по сравнению с другими методами исследования
Правила подготовки пациента к исследованию, условияотбора и хранения исследуемого биоматериала
Вид биоматериала | Подготовка | Хранение |
Моча | При 2-8 С (холодильник) до 24 часов | |
Секрет простаты | Отбирает врач уролог на приеме | При 2-8 С (холодильник) до 24 часов |
Эякулят | Воздержание от половых контактов 3-4 дней, сбор в стерильный одноразовый контейнер путем мастербации (после туалета наружных половых органов и мочеиспускания) | При 2-8 С (холодильник) до 24 часов |
Фекалии | Для анализа собирают пробумассой (объёмом) примерно 1–3 г (1–3 мл в специальный стерильный сухой флакон | При 2-8 С (холодильник) до 48 часов |
Мазки\соскобы из дыхательных путей | Отбирает медицинская сестра или врач. | При 2-8 С (холодильник) до 24 часов |
Мазки\соскобы из урогенитального тракта у женщин (цервикальный канал, влагалище) | При 2-8 С (холодильник) до 24 часов | |
Мазки\соскобы из урогенитального тракта у мужчин(уретра) | При 2-8 С (холодильник) до 24 часов | |
Раневое отделяемое | Отбирает медицинская сестра или врач | При 2-8 С (холодильник) до 24 часов |
Экссудаты, транссудаты | Отбирает медицинская сестра или врач | При 2-8 С (холодильник) до 24 часов |